Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRF4Q15306 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms