Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDGFRLQ15198 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms