Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3GAP1Q15042 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3GAP1Q15042 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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