Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHD4Q14839 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHD4Q14839 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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