Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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RBM39Q14498 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RBM39Q14498 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RBM39Q14498 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RBM39Q14498 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RBM39Q14498 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RBM39Q14498 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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