Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERV3-1Q14264 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERV3-1Q14264 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms