Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IKBKEQ14164 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IKBKEQ14164 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms