Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL4A6Q14031 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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COL4A6Q14031 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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COL4A6Q14031 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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COL4A6Q14031 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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