Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNGB1Q14028 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNGB1Q14028 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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