Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6HQ13956 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6HQ13956 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6HQ13956 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PDE6HQ13956 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PDE6HQ13956 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6HQ13956 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PDE6HQ13956 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6HQ13956 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6HQ13956 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6HQ13956 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6HQ13956 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6HQ13956 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6HQ13956 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6HQ13956 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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