Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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