Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDX39BQ13838 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms