Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPTAN1Q13813 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPTAN1Q13813 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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