Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL4AQ13619 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL4AQ13619 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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