Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC1Q13547 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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