Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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