Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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