Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MTA1Q13330 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms