Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLN3Q13286 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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