Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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