Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF1Q13077 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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