Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TWF1Q12792 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms