Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms