Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ABCC8Q09428 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ABCC8Q09428 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms