Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FAM27E3Q08E93 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms