Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSRP1Q08945 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSRP1Q08945 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms