Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CYP4F3Q08477 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CYP4F3Q08477 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms