Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LRP1Q07954 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms