Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC9Q06265 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms