Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB3Q05901 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms