Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRB3Q04118 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms