Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APBA1Q02410 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APBA1Q02410 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms