Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLTCQ00610 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLTCQ00610 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms