Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBP5P82980 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBP5P82980 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBP5P82980 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBP5P82980 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBP5P82980 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBP5P82980 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBP5P82980 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBP5P82980 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms