Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms