Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GNB1P62873 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GNB1P62873 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms