Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2FP61218 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms