Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF4A1P60842 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EIF4A1P60842 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms