Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCCD1P59942 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCD1P59942 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCD1P59942 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MCCD1P59942 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCCD1P59942 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCCD1P59942 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms