Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHBDL3P58872 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RHBDL3P58872 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms