Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBASH3AP57075 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms