Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BACE1P56817 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BACE1P56817 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BACE1P56817 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BACE1P56817 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BACE1P56817 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BACE1P56817 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BACE1P56817 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms