Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PAX9P55771 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PAX9P55771 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PAX9P55771 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms