Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMD4P55036 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD4P55036 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms