Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M2P53677 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms