Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLTCL1P53675 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCL1P53675 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCL1P53675 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms