Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARFIP2P53365 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms