Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms