Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ETV1P50549 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ETV1P50549 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ETV1P50549 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ETV1P50549 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ETV1P50549 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms