Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSNK1EP49674 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms